Principes généraux du langage R
• Fonctionnement général de R
• Fonctionnalités, avantages, inconvénients
• Installation de R
• Site du projet R et documentation

Interface du logiciel R et notions élémentaires
• Interface et gestion des fenêtres
• Utiliser la console R
• Mode console, mode script
• Organiser un projet R
• Saisir et rappeler des lignes de commandes
• Aide en ligne sur les commandes
 Lecture efficace de l'aide en ligne
 Recherche des commandes R
• Choisir le répertoire de travail
• Affecter des objets (créer des variables)
• Lister, effacer, sauvegarder et charger des objets contenus en mémoire
• Sauver/charger l’environnement de travail et l’historique des commandes
• Configurer le fichier RProfile.site

Création et exécution de scripts simples
• Lecture
• Ecriture
• Commentaires
• Exécution et débogage
• Ouverture sur la création de fonctions personnalisées
• Les bonnes pratiques

Création et manipulation des objets sous R
• Les différentes commandes permettant de créer un vecteur
• Extraction des éléments d'un vecteur
 A partir des indices
 Par le biais d'une condition
• Opérations sur les vecteurs
• Création et manipulation des facteurs (variables qualitatives)
• Création d’un tableau de données (data frame)
• Extraction des éléments d’un dataframe
 A partir des indices
 Avec le $
 Par le biais d'une condition
• Manipulation des data frames
 Modification des noms des lignes, des noms des colonnes
 Suppression d'une colonne
 Ajout d'une colonne
 Tri
 Filtre
 Restructuration de données (stack, reshape,…)
 Fusion de données
• Principes de vectorisation

Importation de données
• Contenues dans un fichier ASCII
• Contenues dans une feuille de calcul Excel
• Contenues dans le presse-papiers

Les fonctions de calculs de base
• Opérateurs arithmétiques (+, -, *, /)
• Opérateurs de comparaisons
• Fonctions mathématiques de base sur les données : log, round, …
• Fonctions de synthèse
 apply
 tapply
 aggregate
 …
• Fonctions statistiques de base
 sum
 mean
 sd
 …

 
Création de graphiques
• Les fonctions graphiques : plot, hist, boxplot, stripchart…
• Gestion des graphiques
 Ouverture de plusieurs fenêtres graphiques
 Partitionnement des graphiques
• Les fonctions graphiques secondaires : points, lines, title, legend…
• Les commandes de mise en forme des graphiques
• Le paramétrage des graphiques

Mettre en œuvre des analyses statistiques de bases sous R
• Analyse descriptive des données
 La description par le chiffre : commandes summary, sd …
 La description par le graphique
• Intervalle de confiance d’une moyenne
• Tests d’hypothèses paramétriques et non paramétriques
 Comparaison des moyennes (Student)
 Comparaison des médianes (Wilcoxon, Mann-Whitney)
 Comparaison des proportions (χ²)
• ANOVA à 1 facteur